Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms