Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP13Q86W25 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms