Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms