Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms