Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PHYHD1Q5SRE7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms