Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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RAB6CQ53S08 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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