Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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