Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP2B3Q16720 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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