Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms