Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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