Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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SCN9AQ15858 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCN9AQ15858 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
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