Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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NPTX1Q15818 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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