Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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NAE1Q13564 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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NAE1Q13564 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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NAE1Q13564 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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NAE1Q13564 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAE1Q13564 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAE1Q13564 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAE1Q13564 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAE1Q13564 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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