Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms