Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP140Q13342 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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