Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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