Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms