Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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