Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms