Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AP000941.1-201ENST00000530198 1388 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms