Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms