Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR1Q03591 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms