Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6Q03468 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms