Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNC1Q01954 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms