Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms