Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms