Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms