Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A1P53007 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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