Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCR4P51679 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCR4P51679 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCR4P51679 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCR4P51679 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR4P51679 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR4P51679 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR4P51679 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms