Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms