Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ME1P48163 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ME1P48163 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ME1P48163 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ME1P48163 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms