Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms