Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms