Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms