Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRBP23467 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PTPRBP23467 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PTPRBP23467 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PTPRBP23467 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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PTPRBP23467 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PTPRBP23467 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PTPRBP23467 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRBP23467 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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