Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO3O43524 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO3O43524 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO3O43524 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO3O43524 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO3O43524 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO3O43524 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO3O43524 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXO3O43524 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms