Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H7C1D1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H7C1D1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H7C1D1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
H7C1D1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
H7C1D1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H7C1D1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H7C1D1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H7C1D1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H7C1D1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1D1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1D1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1D1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1D1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1D1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms