Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LHX3Q9UBR4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms