Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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SH3BP4Q9P0V3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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SH3BP4Q9P0V3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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SH3BP4Q9P0V3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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