Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THUMPD1Q9NXG2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms