Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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