Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms