Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms