Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms