Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms