Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBP4Q8N2S1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms