Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms