Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms