Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms