Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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